# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GenomicInteractions”)

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomicInteractions。

R包处理基因交互数据

Bioconductor版本:3.4

R包处理基因交互数据,比如ChIA-PET /高c基因组功能注释和交互信息和生产各种情节/统计数据。

作者:Harmston N。Ing-Simmons E。佩里,M。,Baresic, A., Lenhard, B.

维护者:利兹Ing-Simmons马尔科姆•佩里< mgperry32 gmail.com > <利兹。在csc.mrc.ac.uk ing-simmons12 >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GenomicInteractions”)

文档

HTML	R脚本	chiapet_vignette.html
HTML	R脚本	GenomicInteractions-HiC
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,嗝,基础设施,软件
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3),InteractionSet
进口	Rsamtools,rtracklayer,GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics(> = 0.15.3),data.table,stringr,GenomeInfoDb,ggplot2、网格gridExtra、方法、igraph,S4Vectors,dplyr,Gviz,Biobase、图形数据,跑龙套
链接
建议	knitr,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ComputationalRegulatoryGenomicsICL/GenomicInteractions/
取决于我
进口我
建议我	芝加哥
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GenomicInteractions_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	GenomicInteractions_1.8.1.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	GenomicInteractions_1.8.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/genomicinteractions/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicInteractions/
包下载报告	下载数据