要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genenetworkbuilder”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

GenEnetworkbuilder

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅GenEnetworkbuilder

从芯片芯片/芯片序列和表达数据构建监管网络

生物导体版本:3.4

应用使用芯片芯片或芯片序列以及微阵列或RNA-seq基因表达数据来发现转录因子的直接或间接靶标。从芯片芯片或CHIP-SEQ输入一个TF的潜在靶标基因列表,以及基因表达结果,GenEnetworkBuilder会产生TF的调节网络。

作者:Jianhong OU,Haibo Liu,Heidi A Tissenbaum和Lihua Julie Zhu

维护者:jianhong ou

引用(从r内,输入引用(“ GenEnetworkbuilder”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ GenEnetworkbuilder”)

PDF R脚本 GenEnetworkBuilder Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(4。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.15.1),RCPP(> = 0.9.13)
进口 plyr,,,,图形
链接 RCPP
建议 运行,,,,生物基因,,,,rgraphviz,,,,XML,,,,rcytoscape,,,,rbgl,,,,尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 GenEnetworkBuilder_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/genenetworkbuilder/tree/Release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genenetworkbuilder/
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