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在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅GenEnetworkbuilder。
生物导体版本:3.4
应用使用芯片芯片或芯片序列以及微阵列或RNA-seq基因表达数据来发现转录因子的直接或间接靶标。从芯片芯片或CHIP-SEQ输入一个TF的潜在靶标基因列表,以及基因表达结果,GenEnetworkBuilder会产生TF的调节网络。
作者:Jianhong OU,Haibo Liu,Heidi A Tissenbaum和Lihua Julie Zhu
维护者:jianhong ou
引用(从r内,输入引用(“ GenEnetworkbuilder”)
):
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Browsevignettes(“ GenEnetworkbuilder”)
R脚本 | GenEnetworkBuilder Vignette | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(4。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.15.1),RCPP(> = 0.9.13) |
进口 | plyr,,,,图形 |
链接 | RCPP |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,rgraphviz,,,,XML,,,,rcytoscape,,,,rbgl,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | GenEnetworkBuilder_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genenetworkbuilder/tree/Release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genenetworkbuilder/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |