安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GeneGeneInteR”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneGeneInteR。
Bioconductor版本:3.4
这个包的目的是提出几种方法病例对照关联研究的基因基因交互测试。这种测试可以通过聚合SNP-SNP SNP级别的交互测试执行(SSI)或通过使用基因基因multidimensionnal方法(GGI)方法。包还提出了工具的图形显示结果。
作者:马修艾米丽,尼古拉•Sounac Florian Kroell, Magalie Houee-Bigot
维护人员:马修艾米丽<马修。艾米丽在agrocampus-ouest.fr >, Magalie Houee-Bigot < Magalie。在agrocampus-ouest.fr houee >
从内部引用(R,回车引用(“GeneGeneInteR”)
):
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GeneGeneInteR”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GeneGeneInteR”)
R脚本 | GeneGeneInteR介绍 | |
R脚本 | 两两交互测试 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.3) |
进口 | snpStats,mvtnorm,GGtools,Rsamtools,igraph,kernlab,FactoMineR,plspm,IRanges,GenomicRanges,data.table,里奥哈葡萄酒、grDevices图形、属性、跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GeneGeneInteR_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | GeneGeneInteR_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛) | GeneGeneInteR_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/genegeneinter/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneGeneInteR/ |
包下载报告 | 下载数据 |