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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneGeneInteR。

工具测试基因基因在基因层面的交流

Bioconductor版本:3.4

这个包的目的是提出几种方法病例对照关联研究的基因基因交互测试。这种测试可以通过聚合SNP-SNP SNP级别的交互测试执行(SSI)或通过使用基因基因multidimensionnal方法(GGI)方法。包还提出了工具的图形显示结果。

作者:马修艾米丽,尼古拉•Sounac Florian Kroell, Magalie Houee-Bigot

维护人员:马修艾米丽<马修。艾米丽在agrocampus-ouest.fr >, Magalie Houee-Bigot < Magalie。在agrocampus-ouest.fr houee >

安装

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文档

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browseVignettes (“GeneGeneInteR”)

PDF	R脚本	GeneGeneInteR介绍
PDF	R脚本	两两交互测试
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,单核苷酸多态性,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3)
进口	snpStats,mvtnorm,GGtools,Rsamtools,igraph,kernlab,FactoMineR,plspm,IRanges,GenomicRanges,data.table,里奥哈葡萄酒、grDevices图形、属性、跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GeneGeneInteR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	GeneGeneInteR_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	GeneGeneInteR_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/genegeneinter/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeneGeneInteR/
包下载报告	下载数据