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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅GSVA。

微阵列和RNA-seq数据的基因集变异分析

生物导体版本：3.4

基因集变异分析（GSVA）是一种非参数，无监督的方法，用于通过表达数据集的样品估计基因集富集的变化。GSVA对坐标系进行了更改，将数据从样品矩阵通过样品矩阵转换为基因集，从而允许评估每个样品的途径富集。GSVA富集的新矩阵得分有助于采用标准分析方法，例如功能富集，生存分析，聚类，CNV-Pathway分析或以途径为中心的方式进行跨组织分析。

作者：贾斯汀·吉尼（Justin Guinney）[AUT，CRE]，Robert Castelo [AUT]

维护者：贾斯汀·吉尼（Justin Guinney）

安装

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文档

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Browsevignettes（“ GSVA”）

PDF	R脚本	基因集变异分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因烯，，，，微阵列，，，，途径，，，，软件
版本	1.22.4
在生物导体中	Bioc 2.8（R-2.13）（6年）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 2.13.0）
进口	方法，生物基因，，，，生物酶，，，，gseabase（> = 1.17.4）
链接
建议	林玛，，，，rcolorbrewer，，，，GeneFilter，，，，mclust，，，，EDGER，，，，雪， 平行，GSVADATA
系统要求
增强
URL	http://www.sagebase.org
取决于我	Sispa
进口我	Egsea，，，，OPPAR
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	gsva_1.22.4.tar.gz
Windows二进制	gsva_1.22.4.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.9（Mavericks）	GSVA_1.22.4.TGZ
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/gsva/tree/release-3.4
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/gsva/
软件包下载报告	下载统计