要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Gseabase”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅GSEABASE.。
Bioconductor版本:3.4
此包提供支持基因集浓缩分析(GSEA)的类和方法。
作者:马丁摩根,罗伯特绅士Seth Falcon
维护者:Bioconductor Package维护者
引文(从R内,输入引文(“GSEABASE”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Gseabase”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“GSEABASE”)
PDF. | r script. | GSEABase介绍 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 去那基因表达那GenesetenRichment.那graphandnetwork.那ke那软件 |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.1(R-2.6)(9.5岁) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.6.0),生物根系(> = 0.13.8),BioBase.(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3),方法,图形(> = 1.37.2) |
进口 | annotationdbi.那XML. |
链接到 | |
建议 | hgu95av2.db.那go.db.那org.hs.eg.db.那rghrachviz那ReportingTools. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | agdex.那双黑色那ccpromise.那cpvsnp.那enrichmentbrowser.那GCMAP.那gsvadata.那NPGSEA.那承诺那泼丝体 |
进口我 | 癌症那类别那CompoundationCompare.那cellhts2.那gcmapweb.那GSRI.那GSVA.那Htsanalyzer.那沼泽那逆口那PCHENO.那现象那承诺那ReportingTools. |
建议我 | Bioccasestudies.那ClusterProfiler.那吐那Globalancova那全球化境那古司裤那GSAR.那GSEALM那桅杆那PGSEA那现象 |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | gseabase_1.36.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | gseabase_1.36.0.zip. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | gseabase_1.36.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/gseabase/tree/release-3.4 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/gseabase/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |