要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GOSemSim")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GOSemSim

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOSemSim

语义相似性度量

Bioconductor版本:3.4

基因本体(GO)注释的语义比较为计算基因和基因组之间的相似性提供了定量方法,已成为许多生物信息学分析方法的重要基础。GOSemSim是一个用于计算GO术语、GO术语集、基因产物和基因簇之间语义相似度的R包。GOSemSim分别实现了Resnik、Schlicker、Jiang、Lin和Wang提出的五种方法。

作者:余光创(guangchuyu at gmail.com>),由Alexey Stukalov和肖传乐贡献。

维护人员:Guangchuang Yu

引用(从R中,输入引用(“GOSemSim”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GOSemSim")

文档

超文本标记语言 R脚本 GOSemSim的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释聚类网络通路软件
版本 2.0.4
在Bioconductor公司 BioC 2.4 (R-2.9)(8年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.0)
进口 AnnotationDbiGO.db,方法,效用
链接 Rcpp
建议 AnnotationHubBiocInstallerBiocStyleclusterProfiler剂量knitrorg.Hs.eg.dbtestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://guangchuangyu.github.io/GOSemSim
BugReports https://github.com/GuangchuangYu/GOSemSim/issues
全靠我 tRanslatome
进口我 clusterProfiler剂量网格Rcpi
建议我 SemDist
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 GOSemSim_2.0.4.tar.gz
Windows二进制 GOSemSim_2.0.4.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.9(小牛队) GOSemSim_2.0.4.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GOSemSim/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/
软件包下载报告 下载数据

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  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网