要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ funcisnp”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅funcisnp。
生物导体版本:3.4
FunCISNP集成了来自GWAS,1000基因组和染色质特征的信息,以识别编码或非编码区域中的功能SNP。
作者:Simoncoetzee.com>的Simon G. Coetzee 维护人员:SimonG.Coetzee 引用(从r内,输入 要安装此软件包,请启动R并输入: 要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入: 跟随bob 体育网址
在R会话中使用此软件包的说明。引用(“ funcisnp”)
):安装
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ funcisnp”)
文档
Browsevignettes(“ funcisnp”)
PDF
R脚本
funcisnp小插图
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参考手册
文本
消息
细节
生物浏览
注解,,,,DataImport,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件
版本
1.18.0
在生物导体中
Bioc 2.11(R-2.15)(4。5年)
执照
GPL-3
要看
r(> = 2.14.0),GGPLOT2,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,funcisnp.data
进口
方法,生物基因,,,,生物酶,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,rsamtools(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.14.1),Chippeakanno(> = 2.2.0),变体,,,,plyr,,,,snpstats,,,,GGPLOT2(> = 0.9.0),重塑(> = 0.8.4),秤
链接
建议
org.hs.eg.db
系统要求
增强
平行
URL
http://coetzeeseq.usc.edu/publication/coetzee_sg_et_al_2012/
取决于我
进口我
建议我
构建报告
包装档案
包源
funcisnp_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
funcisnp_1.18.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks)
funcisnp_1.18.0.tgz
颠覆源
(用户名/密码:ReadOnly)
git源
https://github.com/bioconductor-mirror/funcisnp/tree/release-3.4
包装短URL
//www.anjoumacpherson.com/packages/funcisnp/
软件包下载报告
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