要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ funcisnp”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

funcisnp

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅funcisnp

将功能性非编码数据集与遗传关联研究集成,以识别候选调节性SNP

生物导体版本:3.4

FunCISNP集成了来自GWAS,1000基因组和染色质特征的信息,以识别编码或非编码区域中的功能SNP。

作者:Simoncoetzee.com>的Simon G. Coetzee

维护人员:SimonG.Coetzee Simon>

引用(从r内,输入引用(“ funcisnp”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ funcisnp”)

PDF R脚本 funcisnp小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,DataImport,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 2.14.0),GGPLOT2,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,funcisnp.data
进口 方法,生物基因,,,,生物酶,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,rsamtools(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.14.1),Chippeakanno(> = 2.2.0),变体,,,,plyr,,,,snpstats,,,,GGPLOT2(> = 0.9.0),重塑(> = 0.8.4),
链接
建议 org.hs.eg.db
系统要求
增强 平行
URL http://coetzeeseq.usc.edu/publication/coetzee_sg_et_al_2012/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 funcisnp_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 funcisnp_1.18.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) funcisnp_1.18.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/funcisnp/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/funcisnp/
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