安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“EnrichmentBrowser”)
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EnrichmentBrowser。
Bioconductor版本:3.4
EnrichmentBrowser包实现基本功能富集分析基因表达数据。分析结合了基于集合的优势和基于网络的基因集富集分析以获得高信任度和生物学通路中不同监管表达数据在调查之中。除此之外,包方便的可视化和探索集和途径。
作者:路德维希Geistlinger Gergely Csaba,拉尔夫·齐默
维护人员:路德维希Geistlinger <路德维希。在bio.ifi.lmu.de Geistlinger >
从内部引用(R,回车引用(“EnrichmentBrowser”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“EnrichmentBrowser”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“EnrichmentBrowser”)
R脚本 | EnrichmentBrowser手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,网络,NetworkEnrichment,通路,RNASeq,ReportWriting,软件,可视化 |
版本 | 2.4.6 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.0.0),Biobase,GSEABase,pathview |
进口 | AnnotationDbi,ComplexHeatmap,DESeq2,EDASeq,GO.db,KEGGREST,KEGGgraph,质量,ReportingTools,Rgraphviz,S4Vectors,SPIA,SummarizedExperiment,biocGraph,刨边机,geneplotter,图,hwriter,limma、方法、安全,topGO |
链接 | |
建议 | 所有,BiocStyle,气道,hgu95av2.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | EnrichmentBrowser_2.4.6.tar.gz |
Windows二进制 | EnrichmentBrowser_2.4.6.zip |
Mac OS X 10.9(小牛) | EnrichmentBrowser_2.4.6.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/enrichmentbrowser/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EnrichmentBrowser/ |
包下载报告 | 下载数据 |