要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ewce”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

ewce

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅ewce

表达加权的细胞型富集

生物导体版本:3.4

用于确定哪些细胞类型在基因列表中富集。该软件包提供了在简单基因列表(例如与人类疾病相关的基因)中测试富集的工具以及由差异表达研究产生的工具。该软件包不取决于任何特定的单元转录组数据集,并且可以将用户定义的数据集加载到分析中。

作者:Nathan Skene博士

维护者:Nathan Skene

引用(从r内,输入引用(“ ewce”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ewce”)

文档

html R脚本 用ewce表达加权的细胞型富集
PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物医学信息学,,,,差异性,,,,功能基因组学,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录,,,,可视化,,,,Mrnamicroarray
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.3)
进口 GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,Biomart
链接
建议 尼特,,,,生物使用
系统要求
增强
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包源 ewce_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 ewce_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) ewce_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/ewce/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ewce/
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