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Egsea

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Egsea

基因集富集分析的合奏

生物导体版本:3.4

该软件包实现了用于基因集测试的基因集富集分析(EGSEA)方法。

作者:Montrer Alhamdoosh,Milica Ng和Matthew Ritchie

维护者:Monterer Alhamdoosh

引用(从r内,输入引用(“ Egsea”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ Egsea”)

PDF R脚本 Egsea小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,代谢组学,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,Onechannel,,,,途径,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学,,,,两通道
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1年)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 3.3),生物酶,,,,量规(> = 2.14.4),AnnotationDbi,,,,topgo(> = 2.16.0),PathView(> = 1.4.2)
进口 padog(> = 1.6.0),GSVA(> = 1.12.0),全球测试(> = 5.18.0),林玛(> = 3.20.9),EDGER(> = 3.6.8),htmlutils(> = 0.1.5),HWRITER(> = 1.2.2),GPLOTS(> = 2.14.2),GGPLOT2(> = 1.0.0),安全的(> = 3.4.0),Stringi(> = 0.5.0),并行,统计,代码,grdevices,图形,utils,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,rcolorbrewer, 方法,Egseadata
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Egseadata
构建报告

包装档案

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包源 egsea_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 egsea_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) egsea_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/egsea/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/egsea/
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