要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“EDDA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

埃达

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见埃达

差异丰度分析的实验设计

Bioconductor版本:3.4

EDDA可以帮助设计一系列常见的实验,如RNA-seq、纳米串分析、RIP-seq和宏基因组测序,并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度能力的影响。这项工作发表在2014年12月3日的Genome Biology上,标题为“高通量实验中检测差异丰富特征的研究设计的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/12/527)。

作者:李俊涛,罗怀恩,Chia Kuan Hui Burton, Niranjan Nagarajan

维护者:Chia Kuan Hui Burton , Niranjan Nagarajan

引文(从R内,输入引用(“埃达”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“EDDA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“埃达”)

PDF 《埃达》插曲
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeqExperimentalDesign归一化RNASeq测序软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(3年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 Rcpp(>= 0.10.4),并行,方法,ROCRDESeqbaySeq刨边机
进口 图形,统计,utils,并行,方法,ROCRDESeqbaySeq刨边机
链接 Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 EDDA_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 EDDA_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) EDDA_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/EDDA/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/EDDA/
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文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网