要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“EDDA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见埃达.
Bioconductor版本:3.4
EDDA可以帮助设计一系列常见的实验,如RNA-seq、纳米串分析、RIP-seq和宏基因组测序,并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度能力的影响。这项工作发表在2014年12月3日的Genome Biology上,标题为“高通量实验中检测差异丰富特征的研究设计的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/12/527)。
作者:李俊涛,罗怀恩,Chia Kuan Hui Burton, Niranjan Nagarajan
维护者:Chia Kuan Hui Burton
引文(从R内,输入引用(“埃达”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“EDDA”)
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browseVignettes(“埃达”)
《埃达》插曲 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ChIPSeq,ExperimentalDesign,归一化,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(3年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | Rcpp(>= 0.10.4),并行,方法,ROCR,DESeq,baySeq,雪,刨边机 |
进口 | 图形,统计,utils,并行,方法,ROCR,DESeq,baySeq,雪,刨边机 |
链接 | Rcpp |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527 |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | EDDA_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | EDDA_1.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | EDDA_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/EDDA/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EDDA/ |
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