要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“drudvsdisease”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

药物潜行酶

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅药物潜行酶

基因集富集分析疾病和药物谱的比较

Bioconductor版本:3.4

该包裹产生排名的差异基因表达列表,用于疾病或药物谱。可以从数组Express或Geo或本地CEL文件下载输入数据。使用利马计算排名的差异表达式和相关的p值。浓缩分数(Subramanian等人。PNAS 2005)被计算为参考默认药物或疾病配置文件,或者用户提供的一组自定义数据。在Cytoscape格式中输出大量分数的网络可视化。

作者:C. Pacini

维护者:j。SAEZ-RODRIGUEZ

引文(从R内,输入引文(“药物潜行”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“drudvsdisease”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“药物潜行”)

PDF. r script. 药物潜行酶
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 聚类基因表达微阵列软件
版本 2.14.0
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(4年)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 2.10),敬服林马生物雕ArrayExpress.地理曲线药物潜伏iseaseAledatacmap2data.QValue.
进口 注释hgu133a.db.hgu133a2.db.hgu133plus2.db.运行生物根系xtable.
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 tablvsdisease_2.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件 drudvsdisease_2.14.0.zip.
Mac OS x 10.9(mavericks) drudvsdisease_2.14.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/drugvsdisease/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/drugvsdisease/
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