##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DiffBind”)

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见DiffBind．

ChIP-Seq峰值数据的差分绑定分析

Bioconductor版本:3.4

使用亲和(定量)数据从多个ChIP-seq实验中计算差异绑定位点。还支持占用(重叠)分析和绘图功能。

作者:Rory Stark< Rory。Stark在cruk.cam.ac。Gord Brown

维护者:Rory Stark< Rory。Stark在cruk.cam.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DiffBind”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DiffBind”)

PDF	R脚本	DiffBind: ChIP-Seq峰值数据的差分绑定分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialPeakCalling，测序，软件
版本	2.2.12
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，GenomicRanges，SummarizedExperiment
进口	RColorBrewer，北极监测和评估方案，刨边机，gplotsgrDevices,limma，GenomicAlignments，locfit，统计，utils，IRanges，zlibbioc，晶格，systemPipeR、工具、Rcpp，dplyr，BiocParallel平行,S4Vectors，Rsamtools，DESeq2、方法
链接	Rsamtools(> = 1.19.38),Rcpp
建议	DESeq，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了	rgl，XLConnect
URL
全靠我	ChIPQC
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DiffBind_2.2.12.tar.gz
Windows二进制	DiffBind_2.2.12.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DiffBind_2.2.12.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DiffBind/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DiffBind/
软件包下载报告	下载数据