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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DOQTL。

的基因和QTL定位做老鼠

Bioconductor版本:3.4

DOQTL是一个数量性状位点(QTL)定位映射管道设计的多样性远系小鼠和其他multi-parent远系人群。包读入数据并执行单体型的基因序列重建使用隐马尔科夫模型(HMM)。嗯然后使用的单体型概率执行键映射。当创始人序列可用,DOQTL可以使用单体型重建转嫁创始人序列在基因组和执行关联映射。

作者:丹尼尔•加蒂,卡尔·Broman安德烈Shabalin,切赫Simecek

维护人员:丹尼尔•加蒂<丹。•加蒂jax.org >

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browseVignettes (“DOQTL”)

PDF	R脚本	QTL定位使用多样性远系老鼠
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,HiddenMarkovModel,单核苷酸多态性,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.0),BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,GenomicRanges,VariantAnnotation
进口	注释,annotationTools,biomaRt,Biobase,BiocGenerics,corpcor,doParallel,foreach,fpc,hwriter,IRanges,迭代器,mclust,QTLRel,回归,rhdf5,Rsamtools,RUnit,XML
链接
建议	MUGAExampleData,doMPI
SystemRequirements
增强了
URL	http://do.jax.org
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	DOQTL_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	DOQTL_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9(小牛)	DOQTL_1.10.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/doqtl/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DOQTL/
包下载报告	下载数据