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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅crisprvariants。
生物导体版本:3.4
CRISPRVARIANTS提供了分析CRISPR-CAS9诱变测序实验的结果或其他测序实验的工具,在给定区域内的变体中引起了人们的关注。这些工具使用户可以针对任何基因组位置(例如CAS9切割位点),绘制等位基因组合并通过灵活过滤无关变体的灵活过滤来定位变体等位基因组合。
作者:海伦·林赛[AUT,CRE]
维护者:Helen Lindsay
引用(从r内,输入引用(“ crisprvariants”)
):
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Browsevignettes(“ Crisprvariants”)
R脚本 | crisprvariants | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | CRISPR,,,,datarepresentation,,,,遗传因素,,,,基因组变量,,,,软件,,,,变体挖出,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(1年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.3),GGPLOT2 |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物比较,,,,生物弦, 方法,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,基因组机,grdevices,网格,栅格,,,,iranges,,,,RESHAPE2,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS(> = 0.9.38),UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,gdata,,,,GenomicFeatures,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,rtracklayer,,,,Sangerseqr,,,,测试,,,,变体 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | crisprvariants_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | crisprvariants_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | crisprvariants_1.2.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/crisprvariants/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/crisprvariants/ |
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