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crisprvariants

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅crisprvariants

计算和可视化目标位置突变的工具

生物导体版本:3.4

CRISPRVARIANTS提供了分析CRISPR-CAS9诱变测序实验的结果或其他测序实验的工具,在给定区域内的变体中引起了人们的关注。这些工具使用户可以针对任何基因组位置(例如CAS9切割位点),绘制等位基因组合并通过灵活过滤无关变体的灵活过滤来定位变体等位基因组合。

作者:海伦·林赛[AUT,CRE]

维护者:Helen Lindsay

引用(从r内,输入引用(“ crisprvariants”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ Crisprvariants”)

PDF R脚本 crisprvariants
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 CRISPR,,,,datarepresentation,,,,遗传因素,,,,基因组变量,,,,软件,,,,变体挖出,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.3),GGPLOT2
进口 AnnotationDbi,,,,生物比较,,,,生物弦, 方法,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,基因组机,grdevices,网格,栅格,,,,iranges,,,,RESHAPE2,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS(> = 0.9.38),UTILS
链接
建议 生物使用,,,,gdata,,,,GenomicFeatures,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,rtracklayer,,,,Sangerseqr,,,,测试,,,,变体
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

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包源 crisprvariants_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 crisprvariants_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) crisprvariants_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/crisprvariants/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/crisprvariants/
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