安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChromHeatMap”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChromHeatMap。
Bioconductor版本:3.4
ChromHeatMap包可以用来情节全基因组数据(如表情、全息、SNP)给定的每一链染色体热图。生成的热量地图可用于交互识别探测器和感兴趣的基因。
作者:蒂姆·f·雷纳
维护人员:蒂姆·f·雷纳< tfrayner gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“ChromHeatMap”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChromHeatMap”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ChromHeatMap”)
R脚本 | 策划与ChromHeatMap表达数据 | |
参考手册 |
biocViews | 软件,可视化 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(7.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.9.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0) |
进口 | Biobase(> = 2.17.8)、图形grDevices,方法,属性,IRanges,rtracklayer,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | 所有,hgu95av2.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | ChromHeatMap_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | ChromHeatMap_1.28.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛) | ChromHeatMap_1.28.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/chromheatmap/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChromHeatMap/ |
包下载报告 | 下载数据 |