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Illumina人甲基化450和史诗的碎片分析甲基化管道

Bioconductor版本：3.4

该包包括质量控制度量，各种归一化方法和新的方法，用于识别差分甲基化区域并突出显示拷贝数改变。

作者：袁天[CRE，AUT]，Tiffany Morris [CTB]，Lee Stirling [CTB]，Andrew Feater [CTB]，Andrew Teschendorff [CTB]，Ankur Chakravarthy [CTB]

维护者：元天

安装

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文件

HTML.	r script.	CHAMP：芯片分析甲基化管道
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	CopyNumber.那德甲基化那甲基化阵列那微阵列那正常化那软件那两种通道
版本	2.6.4
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（3.5岁）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 3.3），Minfi.那Champdata.（> = 2.6.0），FEM（> = 3.1），dmrcate.那Illumina450probobevariants.db.那IlluminahumanMethationPicmanifest.
进口	SVA.那Illuminahumanmethylation450kmanifest.那林马那rpmm.那dnacopy.那预处理核那赋予那马拉莱那西瓜那普利尔那Goseq.那Genomicranges.那reffreeewas.那QValue.那ISVA.那多达齐全那Bumphunter.那Quadprog.那闪亮的那Shinythemes.那情节（> = 4.5.6），rcolorbrewer.那dendextend.那MatrixStats.
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.
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包档案包

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包来源	Champ_2.6.4.tar.gz.
Windows二进制文件	Champ_2.6.4.zip.
Mac OS x 10.9（mavericks）	CHAMP_2.6.4.TGZ.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/champ/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/champ/
包裹下载报告	下载统计信息