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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Bionet。
生物导体版本:3.4
该软件包为蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测提供了功能。可以通过将统计测试的p值分配给网络节点来集成到网络中。例如。从Affymetrix阵列的基因的差分表达获得的P值分配给网络节点。通过拟合β-均匀的混合模型并计算来自p值的得分,可以计算网络区域的整体得分,并且整数线性编程算法可以识别最大评分子网络。
作者:Marcus Dittrich和Daniela Beisser
维护者:marcus dittrich
引用(从r内,输入引用(“ Bionet”)
):
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Browsevignettes(“ Bionet”)
R脚本 | Bionet教程 | |
参考手册 |
生物浏览 | DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.7(R-2.12)(6。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 2.10.0),图形,,,,rbgl |
进口 | Igraph(> = 1.0.1),AnnotationDbi,,,,生物酶 |
链接 | |
建议 | RGL,,,,算,,,,DLBCL,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,全部,,,,林玛,,,,HGU95AV2.DB,,,,XML |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ |
取决于我 | |
进口我 | HTSANALYZER,,,,Smite |
建议我 | 圣诞老人 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Bionet_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | bionet_1.34.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Bionet_1.34.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/bionet/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bionet/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |