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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见BiSeq．

亚硫酸氢盐测序数据的处理和分析

Bioconductor版本:3.4

BiSeq包提供了有用的类和函数来处理和分析靶向亚硫酸氢盐测序(BS)数据，如还原表示亚硫酸氢盐测序(RRBS)数据。特别是，它实现了一种检测差异甲基化区域(DMRs)的算法。该包从一个或多个样本中获取已经对齐的BS数据。

作者:Katja Hebestreit, Hans-Ulrich Klein

维护者:Katja Hebestreit

安装

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文档

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browseVignettes(“BiSeq”)

PDF	R脚本	BiSeq简介
PDF		参考手册

细节

biocViews	DNAMethylation，遗传学，MethylSeq，测序，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(4年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(>= 2.15.2)，方法，S4Vectors，IRanges(> = 1.17.24),GenomicRanges，SummarizedExperiment(> = 0.2.0),公式
进口	方法,BiocGenerics，Biobase，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，SummarizedExperiment，rtracklayer平行,betareg，lokern，公式，globaltest
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	RRBSdata
进口我	M3D
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	BiSeq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	BiSeq_1.14.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	BiSeq_1.14.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/BiSeq/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiSeq/
软件包下载报告	下载数据