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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BPRMeth。

模型高阶甲基化的概要文件

Bioconductor版本:3.4

BPRMeth包使用二项式概率单位回归可能性模型甲基化的概要文件和提取高阶特性。这些特性精确量化的甲基化的概念。使用这些高阶特性promoter-proximal地区,我们构造一个预测基因表达的有力证据。同时,这些特性用于集群proximal-promoter地区使用EM算法。

作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani (aut (cre)

维护人员:Chantriolnt-Andreas Kapourani < kapouranis。安德烈亚斯在gmail.com >

安装

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browseVignettes (“BPRMeth”)

PDF	R脚本	介绍BPR方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,聚类,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,KEGG,RNASeq,回归,测序,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3.0),GenomicRanges
进口	为了、方法、质量,doParallel平行,e1071,地球,foreach,randomForest统计数据,IRanges,S4Vectors,data.table、图形
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	BPRMeth_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	BPRMeth_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	BPRMeth_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/bprmeth/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/
包下载报告	下载数据