安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ArrayExpressHTS”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

ArrayExpressHTS

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ArrayExpressHTS

ArrayExpress高通量测序处理管道

Bioconductor版本:3.4

公共ArrayExpress RNA-Seq处理管道实验或本地数据集

作者:安琪拉Goncalves,安德鲁Tikhonov

维护人员:安吉拉Goncalves < filimon ebi.ac。英国>,安德鲁Tikhonov <安德鲁在ebi.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“ArrayExpressHTS”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ArrayExpressHTS”)

文档

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browseVignettes (“ArrayExpressHTS”)

PDF R脚本 ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews RNASeq,测序,软件
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(6年)
许可证 艺术授权2.0
取决于 抽样,Rsamtools(> = 1.19.36),
进口 Biobase,BiocGenerics,Biostrings,DESeq,GenomicRanges,Hmisc,IRanges,R2HTML,RColorBrewer,Rsamtools,ShortRead,XML,biomaRt,刨边机、grDevices、图形、方法rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailR,bitops
链接 Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 ArrayExpressHTS_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(小牛) ArrayExpressHTS_1.24.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/arrayexpresshts/tree/release - 3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/
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