##如果不支持HTTPS：// URL，请尝试http：//源（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“AnnotationHub”）

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本，请参阅annotationhub.。

客户端访问AnnotationHub资源

Bioconductor版本：3.4

此包为Biocuconsion AnnotationHub Web资源提供客户端。AnnotationHub Web资源可以提供一个中央位置，可以发现来自标准位置的基因组文件（例如，VCF，床，WIG）和其他资源，可以发现标准位置（例如，UCSC，EnsemBl）。该资源包括关于每个资源的元数据，例如，文本描述，标签和修改日期。客户端创建并管理用户检索的文件的本地缓存，帮助快速和可重复的访问。

作者：Marc Morgan [Cre]，Marc Carlson [CTB]，Dan Tenenbaum [CTB]，Sonali Arora [CTB]

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此包，请启动R并输入：

##如果不支持HTTPS：// URL，请尝试http：//源（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“AnnotationHub”）

文件

HTML.	r script.	AnnotationHub：访问AnnotationHub Web服务
HTML.	r script.	AnnotationHub：AnnotationHub如何
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	DataImport.那吉伊那基础设施那软件那第三个龙客
版本	2.6.5
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（4年）
执照	艺术-2.0
依靠	生物根系（> = 0.15.10）
进口	Utils，方法，grdevices，rsqlite.那生物粘合剂那annotationdbi.那S4Vectors.那interactiveDisplayPase.那httr.那yaml.
链接到
建议	绞喉那Genomicranges.那genomeinfodb.那VariantAnnotation.那RSAMTOOLS.那rtracklayer.那生物焦那kn那annotationforge.那rbiopaxparser.那运行那基因组法那msnbase.那MZR.那生物仪器那概括分析
系统要求
加强	annotationhubdata.
URL.
取决于我	annotationhubdata.那腌制胶癌那实验室那ProteomicsannotationHubData.那refnet.
进口我	Alpinedata.那alleteringplicingevents.hg19.那annotatr.那Ensembldb.那Grasp2DB.那Gwascat那psichomics.那粉末
建议我	芝加哥那Cindex.那ClusterProfiler.那dnashaper.那Dupradar.那Genomicranges.那Gosemsim.那msnbase.那Organismdbi.那PBASE.那VariantAnnotation.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	AnnotationHub_2.6.5.tar.gz.
Windows二进制文件	annotationhub_2.6.5.zip.
Mac OS x 10.9（mavericks）	annotationhub_2.6.5.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/annotationhub/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/annotationhub/
包裹下载报告	下载统计信息