要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AnnotationForge")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见AnnotationForge.
Bioconductor版本:3.4
提供用于生成注释包及其数据库的代码。生成的包旨在与AnnotationDbi一起使用。
作者:Marc Carlson, Herve Pages
维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者
引用(从R中,输入引用(“AnnotationForge”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AnnotationForge")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“AnnotationForge”)
R脚本 | AnnotationForge:为自定义注释资源创建选择接口 | |
R脚本 | 创建探测包 | |
R脚本 | SQLForge:一种使用标准数据库模式创建新注释包的简单方法。 | |
超文本标记语言 | R脚本 | 制作新的生物体包装 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,基础设施,软件 |
版本 | 1.16.1 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.7.0),方法,utils,BiocGenerics(> = 0.15.10),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14) |
进口 | DBI,RSQLite,XML,S4Vectors,RCurl |
链接 | |
建议 | biomaRt,httr,GenomeInfoDb,Biostrings,affy,hgu95av2.db,human.db0,org.Hs.eg.db,Homo.sapiens,hom.Hs.inp.db,GO.db,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | AnnotationHubData,GGHumanMethCancerPanelv1.db,GOstats |
建议我 | AnnotationDbi,AnnotationHub |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | AnnotationForge_1.16.1.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationForge_1.16.1.zip |
Mac OS X 10.9(小牛队) | AnnotationForge_1.16.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/AnnotationForge/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationForge/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |