要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AnnotationForge")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

AnnotationForge

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见AnnotationForge

构建注释数据库包的代码

Bioconductor版本:3.4

提供用于生成注释包及其数据库的代码。生成的包旨在与AnnotationDbi一起使用。

作者:Marc Carlson, Herve Pages

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“AnnotationForge”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AnnotationForge")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“AnnotationForge”)

PDF R脚本 AnnotationForge:为自定义注释资源创建选择接口
PDF R脚本 创建探测包
PDF R脚本 SQLForge:一种使用标准数据库模式创建新注释包的简单方法。
超文本标记语言 R脚本 制作新的生物体包装
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释基础设施软件
版本 1.16.1
在Bioconductor公司 BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.7.0),方法,utils,BiocGenerics(> = 0.15.10),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14)
进口 DBIRSQLiteXMLS4VectorsRCurl
链接
建议 biomaRthttrGenomeInfoDbBiostringsaffyhgu95av2.dbhuman.db0org.Hs.eg.dbHomo.sapienshom.Hs.inp.dbGO.dbBiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 AnnotationHubDataGGHumanMethCancerPanelv1.dbGOstats
建议我 AnnotationDbiAnnotationHub
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 AnnotationForge_1.16.1.tar.gz
Windows二进制 AnnotationForge_1.16.1.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) AnnotationForge_1.16.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/AnnotationForge/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationForge/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网