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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见AneuFinder．

单细胞测序数据拷贝数变异分析

Bioconductor版本:3.4

该软件包实现了对全基因组单细胞测序数据进行CNV调用、绘图、导出和分析的功能。

作者:Aaron Taudt, Bjorn Bakker, David Porubsky

维护者:Aaron Taudt < Aaron。Taudt在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AneuFinder”)

PDF	R脚本	快速介绍AneuFinder
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，GenomicVariation，HiddenMarkovModel，软件，WholeGenome
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3)，GenomicRanges，cowplot，AneuFinderData
进口	方法，utils, grDevices，图形，统计，foreach，doParallel，BiocGenerics，S4Vectors，GenomeInfoDb，IRanges，Rsamtools，bamsignals，DNAcopy，Biostrings，GenomicAlignments，ggplot2，reshape2，ggdendro，ggrepel，ReorderCluster，mclust
链接
建议	knitr，BiocStyle，testthat，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ataudt/aneufinder.git
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	AneuFinder_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	AneuFinder_1.2.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	AneuFinder_1.2.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/AneuFinder/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AneuFinder/
软件包下载报告	下载数据