要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ aspli”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅阿斯普利。
生物导体版本:3.4
使用RNASEQ进行替代剪接分析的集成管道。
作者:Estefania Mancini,Marcelo Yanovsky和Ariel Chernomoretz
维护者:estefania mancini
引用(从r内,输入引用(“ aspli”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ aspli”)
R脚本 | 使用ASPLI分析替代剪接 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,替代方案,,,,覆盖范围,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,基因数,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,时间科,,,,转录 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(0.5岁) |
执照 | GPL |
要看 | 方法,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,EDGER,,,,生物基因,,,,iranges,,,,基因组签名,,,,deseq2,,,,dexseq,,,,GVIZ,grdevices,统计,utils,S4VECTORS,,,,AnnotationDbi, 平行 |
进口 | |
链接 | |
建议 | rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | aspli_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | aspli_1.0.0.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | aspli_1.0.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/aspli/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/aspli/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |