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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅ALDEX2。

考虑样品变化的差异丰度分析

生物导体版本：3.4

比较两个或多个条件的差异丰度分析。例如，单生物和Meta-RNA-Seq高通量测序测定法，或从视野内序列选择中选择的和未选择的值。使用Dirichlet-Multinomial模型从计数中推断出丰度，该模型已针对三个或更多的实验重复进行了优化。在使用Wilcox等级测试或WELCHES t检验（ALDEX.TTEST）或GLM和KRUSKAL WALLIS测试（ALDEX.GLM）的生物学和采样变化的情况下，Inters采样变化并计算了预期的错误发现率。报告由Benjamini Hochberg校正计算得出的P和FDR值。

作者：格雷格·格洛尔（Greg Gloor），露丝·格雷斯·王（Ruth Grace Wong），安德鲁·费尔南德斯（Andrew Fernandes），阿里安娜·阿尔伯特（Arianne Albert），马特·林克斯（Matt Links）

维护者：greg gloor ggloor

安装

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文档

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browsevignettes（“ aldex2”）

PDF	R脚本	用于确定高通量测序实验中差异丰度的R包装
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	贝叶斯，，，，chipseq，，，，dnaseq，，，，差异性，，，，基因表达，，，，宏基因组学，，，，微生物组，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（2。5年）
执照	文件许可证
要看	方法
进口	S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征，，，，生物比较
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
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建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	aldex2_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	aldex2_1.6.0.zip
Mac OS X 10.9（Mavericks）	aldex2_1.6.0.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/aldex2/tree/release-3.4
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/aldex2/
软件包下载报告	下载统计