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甲状旁腺

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅甲状旁腺

Haglund等人,J Clin Clin Endocrinol Metab 2012的甲状旁腺原发性培养物RNA-seq的RANGEDSUMMARIZERIADSPERIMENT。

生物导体版本:3.2

该软件包提供了来自甲状旁腺肿瘤原发性培养物的实验中的基因和外显子零件中读数读数的范围内化对象。数据列于“甲状腺腺瘤中功能性雌激素受体的证据”,由Haglund F,Ma R,Huss M,Huss M,Sulaiman L,Lu M,Lu M,Nilsson IL,Hoog A,Juhlin CC,Juhlin CC,Hartman C,Hartman J,Larsson C,J,Larsson C,J,J,J。临床内分泌代替。JC.2012-2484,EPUB 2012年9月28日,PMID:23024189。在3个条件下(DPN,OHT和对照)对4例患者的肿瘤培养物进行测序。由于低质量,纸质作者省略了一个控制样本。软件包Vignette描述了NCBI基因表达式Omnibus在登录号GSE37211下提供的原始测序数据的创建。基因和外显子特征是GRCH37 ENEMBL注释。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“甲状旁腺”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“甲状旁腺”)

PDF 甲状旁腺
PDF 参考手册

细节

生物浏览 实验数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据
版本 1.8.0
执照 LGPL
要看 总结性特征,R(> = 2.10)
进口
链接
建议 rsamtools,,,,基因组签名,,,,地球,,,,Sradb,,,,GenomicFeatures,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 分类,,,,dexseq,,,,Simulatorz
构建报告

包装档案

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包源 甲状旁腺甲_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/parathyroidse/
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