要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("ind1KG")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ind1KG

此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ind1KG

数据来自1000个基因组,NA19240(女)chr6节选

Bioconductor版本:3.2

samtools/bioc工作流的元素,用于处理个人序列,专注于罕见变体的识别和解释

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

引用(从R中,输入引用(“ind1KG”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("ind1KG")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“ind1KG”)

PDF ind1KG—1000个基因组数据演示
PDF eSet开发人员注意事项bob电竞体育官网
PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentData基因组MicroarrayDataSNPData
版本 0.8.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10.1),筷子
进口
链接
建议 RsamtoolsrtracklayerGenomicFeaturesorg.Hs.eg.dbSNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGenelumiHumanIDMappingGGBaseGGtoolshmyriB36
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 ind1KG_0.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ind1KG/
包下载报告 下载数据

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支持»

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