要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gageData”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见gageData。
Bioconductor版本:3.2
这是一个支持软件包的软件包,gage。然而,这里提供的数据一般也适用于基因集或通路分析或微阵列数据分析。在这个包中,我们提供了两个演示微阵列数据集:GSE16873(来自GEO的乳腺癌数据集)和BMP6(最初作为GAGE的演示数据集发布,也在GEO中注册为GSE13604)。该软件包还包括基于KEGG途径和主要研究物种(包括人类、小鼠、大鼠和出芽酵母)的GO术语的常用基因集数据。还包括出芽酵母常见基因id之间的映射数据。
作者:罗维钧
维护者:Weijun Luo < Luo Weijun at yahoo.com>
引文(从R内,输入引用(“gageData”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gageData”)
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BreastCancerData,CancerData,ExperimentData,地理,MicroarrayData,干细胞的 |
版本 | 2.8.0 |
许可证 | GPL (> = 2.0) |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 计,pathview,genefilter |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 计,ToPASeq |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | gageData_2.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gageData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |