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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14．

RNAseq实验:通过高通量测序HNRNPC敲低和对照HeLa细胞的转录分析

Bioconductor版本:3.2

该包包含8个BAM文件，每运行一个测序文件。每个BAM文件通过以下步骤获得:(1)用TopHat2将reads(配对端)对准hg19完整基因组，然后(2)将子集设置为只对chr14进行对准。有关实验的详细信息，请参阅ArrayExpress数据库中的登录号E-MTAB-1147，包括已发表的研究(扎纳克等人，2012年)和FASTQ文件的链接。

作者:H. Pages

维护:H. Pages

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ArrayExpress，ExperimentData，地理，基因组，Homo_sapiens_Data，NCI，RNASeqData，SequencingData
版本	0.8.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	GenomicAlignments，BiocInstaller
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
全靠我
进口我
建议我	BiocParallel，GenomicAlignments，GenomicFiles，咆哮，Rsamtools，SplicingGraphs
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
软件包下载报告	下载数据