要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“phastcon100way . ucsc .hg19”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

phastCons100way.UCSC.hg19

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见phastCons100way.UCSC.hg19

UCSC phastCons对hg19的保护评分

Bioconductor版本:3.2

存储UCSC phastCons对人类基因组(hg19)的保护分数,从与其他99种脊椎动物的多次比对中计算。

作者:罗伯特·卡斯特罗

维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>

引文(从R内,输入引用(“phastCons100way.UCSC.hg19”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“phastcon100way . ucsc .hg19”)

文档

PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensPhastConsDb
版本 3.2.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.0.0),VariantFiltering(> = 1.5.24)
进口 跑龙套,IRangesGenomicRangesBSgenome
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 VariantFiltering

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 phastCons100way.UCSC.hg19_3.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/phastCons100way.UCSC.hg19/
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