安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38。
Bioconductor版本:3.2
额外的SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP构建144。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月30日,2015年,包含snp GRCh38映射到参考基因组。p2 (GRCh38的补丁版本,并不改变染色体22页,X, Y, MT)。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144。GRCh38包只包含分子变化类“国民党”,这个包包含其他类的分子变化(named-locus (del、杂合的微卫星,缺乏变化,混合,和multinucleotide-polymorphism)。
作者:Herve页面
维修工:h .页< hpages fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs |
版本 | 0.99.12 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.10),BSgenome |
进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.12.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/ |
包下载报告 | 下载数据 |