安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

额外的SNP地点智人(dbSNP构建144)

Bioconductor版本:3.2

额外的SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP构建144。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月30日,2015年,包含snp GRCh38映射到参考基因组。p2 (GRCh38的补丁版本,并不改变染色体22页,X, Y, MT)。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144。GRCh38包只包含分子变化类“国民党”,这个包包含其他类的分子变化(named-locus (del、杂合的微卫星,缺乏变化,混合,和multinucleotide-polymorphism)。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs
版本 0.99.12
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),BSgenome
进口 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议 Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
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