要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

智人的额外SNP位置(dbSNP Build 141)

Bioconductor版本:3.2

从NCBI dbSNP Build 141中提取的智人额外SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2014年5月1日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。而snplc . hapiens . dbsnp141 . dbsnp141 . dbsnp141。GRCh38包仅包含“snp”类的分子变异,该包包含其他类的分子变异(in-del、杂合、微卫星、命名位点、无变异、混合和多核苷酸多态性)。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

引文(从R内,输入引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensXtraSNPlocs
版本 0.99.12
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),S4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome(> = 1.35.5)
进口 方法,跑龙套,S4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38(> = 1.3.19)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 BSgenome

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38/
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