要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38.
Bioconductor版本:3.2
从NCBI dbSNP Build 141中提取的智人额外SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2014年5月1日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。而snplc . hapiens . dbsnp141 . dbsnp141 . dbsnp141。GRCh38包仅包含“snp”类的分子变异,该包包含其他类的分子变异(in-del、杂合、微卫星、命名位点、无变异、混合和多核苷酸多态性)。
作者:Herve Pages
维护:H. Pages
引文(从R内,输入引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs |
版本 | 0.99.12 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome(> = 1.35.5) |
进口 | 方法,跑龙套,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38(> = 1.3.19) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | BSgenome |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38_0.99.12.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38/ |
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