要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

智人的SNP位点(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:3.2

从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人SNP位点和等位基因用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p2 (GRCh38的补丁版本,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以被“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或bsgenome . hspiens . ucsc .hg38。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

引文(从R内,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensSNPlocs
版本 0.99.11
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),BSgenome
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.11.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心