安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427

这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427

SNP地点智人(dbSNP构建131)

Bioconductor版本:3.2

SNP等位基因位置和智人从dbSNP建造131:human_9606(基于GRCh37)。源数据文件用于这个包是由NCBI 2010年3月24 - 26日。警告:这个包的单核苷酸多态性是基于GRCh37基因组。注意,GRCh37基因组是一样的hg19从UCSC基因组除了线粒体染色体。因此,单核苷酸多态性在这个包可以在BSgenome.Hsapiens.UCSC“注入”。hg19但这注入排除chrM(即序列将被注入无关)。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens
版本 0.99.7
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),IRanges,GenomicRanges
进口 方法,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges
链接
建议 Biostrings,BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427_0.99.7.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427/
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