安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506

这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506

SNP地点智人(dbSNP构建130)

Bioconductor版本:3.2

SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP建造130。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月5 - 6,2009年,并包含snp映射到参考基因组NCBI构建36.1,这是相同的hg18 UCSC基因组。因此,单核苷酸多态性在这个包可以在BSgenome.Hsapiens.UCSC“注入”。hg18他们会降落在正确的位置。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens
版本 0.99.9
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),IRanges,GenomicRanges,BSgenome(> = 1.25.6)
进口 方法,跑龙套,IRanges,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议 Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18(> = 1.3.19)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 ind1KG

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506_0.99.9.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506/
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