安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506。
Bioconductor版本:3.2
SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP建造130。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月5 - 6,2009年,并包含snp映射到参考基因组NCBI构建36.1,这是相同的hg18 UCSC基因组。因此,单核苷酸多态性在这个包可以在BSgenome.Hsapiens.UCSC“注入”。hg18他们会降落在正确的位置。
作者:Herve页面
维修工:h .页< hpages fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 0.99.9 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.10),IRanges,GenomicRanges,BSgenome(> = 1.25.6) |
进口 | 方法,跑龙套,IRanges,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18(> = 1.3.19) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | ind1KG |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506_0.99.9.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506/ |
包下载报告 | 下载数据 |