要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.ucsc.mmm8.masked”)
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此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8.masked。
生物导体版本:3.2
UCSC(2006年2月MM8)提供的Mus Musculus(小鼠)的完整基因组序列,并存储在生物弦物体中。这些序列与BSGENOME.MMUSCULUS.UCSC.MM8相同,除了它们每个都有4个后面的掩码:(1)组装间隙的掩码(Agaps Mask)(AGAPS MAKS),(2)内部内部的掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8.masked”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ bsgenome.mmusculus.ucsc.ucsc.mmm8.masked”)
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,mus_musculus |
版本 | 1.3.99 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8 |
进口 | BSGENOME,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8 |
链接 | |
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系统要求 | |
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建议我 | rtrm |
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包源 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.mmusculus.ucsc.mm8.masked/ |
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