安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked。
Bioconductor版本:3.2
完整的基因组序列智人(人类)提供的UCSC (hg18, 2006年3月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Hsapiens.UCSC序列是一样的。hg18,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。
作者:Bioconductor Dev团队
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 1.3.99 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
进口 | BSgenome,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | r3Cseq |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked/ |
包下载报告 | 下载数据 |