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bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3.masked

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3.masked

果蝇Melanogaster(UCSC版本DM3)的完整掩盖基因组序列

生物导体版本:3.2

UCSC(DM3,2006年4月)提供的果蝇Melanogaster(Fly)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3中的序列相同,除了它们每个序列都在顶部有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(agaps mask)(agaps mask),(2)contra Intra Intra Contig的掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。

作者:生物导体开发团队

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3.masked”)):

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生物浏览 AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,Drosophila_melanogaster,,,,遗传学
版本 1.3.99
执照 艺术2.0
要看 BSGENOME(> = 1.31.8),bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3
进口 BSGENOME,,,,bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3
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