RnBeads是一个R包，用于全面分析通过任何实验协议获得的DNA甲基化数据，提供单cpg分辨率，包括Infinium 450K微阵列和亚硫酸氢盐测序协议，但也包括MeDIP-seq和MBD-seq，一旦数据已经用DNA甲基化推断软件预处理。RnBeads实现了一个比现有工具更全面的分析工作流。它将结果记录在一个高度注释和可读的超文本报告中，并扩展到大样本量，这正在成为人类队列DNA甲基化分析的标准。