1.10.0-1.10.6版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o版本号撞了Bioconductor发布版本3.2 o解决内存问题的seqAlleleFreq()”当“ref.allele”是一个矢量o ' seqSetFilter()允许数值向量在桑普。选取”和“变体。选取“o”seqSummary()的返回倍性和参考点seqStorage.Option()的控制/数据格式的压缩级别o ' seqVCF2GDS()允许提取部分的VCF文件通过“开始”和“数”o ' seqMerge()的结合多个GDS文件相同的样品出口方法兼容VariantAnnotation o新论点。useraw '在' seqGetFilter()允许o新论点。复制”在“seqOpen()的o修复一个缺陷的seqParallel ()”(https://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues/11)和优化其性能的gdsfile的可能是零”seqParallel()的变化版本1.9.0-1.9.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o新功能“seqGDS2SNP () ' o SNPRelate包支持的o支持seqApply (…,保证金= " by.sample”)“o新功能”seqOptimize ()”、“seqMissing ()”、“seqAlleleFreq ()”、“seqNumAllele()”和“seqSetFilterChrom () ' o“交叉”和“推动+十字路口”在“seqSetFilter()的o并行实现的seqNumAllele ()”、“seqMissing()”和“seqAlleleFreq () o一个新函数的seqExport()的o新观点”。useraw”“seqApply()的o修复一个缺陷重复“变体。id”, https://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues/7的修复一个问题阿seqVCF2GDS()“当有重复的格式或信息id o提高访问速度(+ 50%,基准呼吁seqApply (…、有趣= function (x) {})) o新功能“seqSNP2GDS ()”,“seqBED2GDS ()”,“seqAlleleCount()”和“seqResetFilter()的o ' seqCompress。选择“重命名”seqStorage。选择“o”ZIP_RA”的默认值是“seqStorage.Option()而不是“ZIP_RA”和其他功能。马克斯“o”seqSetFilter()”成为S4方法版本1.8.0的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o版本号撞了Bioconductor发布3.1版本的变化版本1.7.1-1.7.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o bug修复在基因型如果位置> 2 ^ 31 o ' ignore.chr添加一个选项。前缀“函数”seqVCF2GDS()的o ' seqVCF2GDS()”忽略了信息或格式变量如果他们没有提前o定义一个新的行动”推进+设置”功能的seqSetFilter()的bug修复,如果阿requireNamespace (“SeqArray”)的称为其他包版本1.6.0变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o版本号撞了Bioconductor发布3.0版本的变化版本1.5.1-1.5.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o修复一个缺陷在“seqVCF2GDS()当过滤列中的值都是失踪o提高“seqVCF.Header()的链接机制支持o修复错误单倍体基因型(Y染色体)的变化版本1.4.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o Bioconductor发布版本的版本号是撞1.3.1-1.3.4版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o更新的新版本VariantAnnotation o更新测试代码,以避免冲突o撞版所有包,取决于Rcpp必须重建o修改新biocViews 1.2.0版本描述文件变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o Bioconductor发布版本的版本号是撞1.1.4-1.1.5版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o添加一个新参数“行动”功能的seqSetFilter ()”o添加新功能“seqInfoNewVar”允许添加新的变量信息字段o小bug修复在asVCF o SeqVarGDSClass-class更新页面的人”。Rd”描述新方法o, BiocGenerics列在“建议”,而不是“进口”所显示R CMD检查o bug修复seqDelete o修改函数的seqTranspose根据更新gdsfmt (v1.0.0)的变化版本1.1.1-1.1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o函数中修改参数“var.index”“seqApply()”的基本支持阿“农庄”和“DNAStringSetList”o添加方法‘战’,‘filt’,‘asVCF o农庄的方法使用参考基因集的长度宽度o小bug修复,避免“seqGetData()的崩溃当没有返回值从一个变长变量o更新文件版本1.0.0的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o Bioconductor发布版本的版本号是撞0.99.0版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o首次提交