要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("xcms")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

xcms

此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见xcms

LC/MS和GC/MS数据分析

Bioconductor版本:3.2

色谱分离和单光谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NetCDF, mzXML, mzData和mzML文件导入。预处理数据,用于高通量,非目标分析物分析。

作者:Colin A. Smith , Ralf Tautenhahn , Steffen Neumann , Paul Benton < hbenton at scripps.edu>, Christopher Conley , Johannes Rainer

维护人员:Steffen Neumann

引用(从R中,输入引用(“xcms”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("xcms")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“xcms”)

PDF 用xcms对FTICR-MS数据进行分组
PDF xcms安装说明
PDF 用xcms进行LC/MS预处理与分析
PDF 用xcms处理串联MS和MS$^n$数据
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews MassSpectrometry代谢组学软件
版本 1.46.0
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 GPL(>= 2) +文件许可证
取决于 R(>= 2.14.0),方法,mzR(> = 1.1.6),BiocGenericsProtGenericsBiobase
进口 晶格RColorBrewer
链接
建议 faahKOmsdatancdf,rglMassSpecWavelet(> = 1.5.2),RANNRUnit、并行
SystemRequirements
增强了 RgraphvizRmpiXML
URL http://metlin.scripps.edu/download/而且https://github.com/sneumann/xcms
BugReports https://github.com/sneumann/xcms/issues/new
全靠我 相机faahKOflagme金属底座metaMS
进口我 相机cosmiqMAITmetaXRisa
建议我 MassSpecWaveletmsdatamtbls2RforProteomicsRMassBank
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 xcms_1.46.0.tar.gz
Windows二进制 xcms_1.46.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) xcms_1.46.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) xcms_1.46.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/xcms/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/xcms/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心