要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“trackViewer”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

trackViewer

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见trackViewer

具有极简设计的生物导体包,用于绘制优雅的轨道层

Bioconductor版本:3.2

将映射的读取以及注释作为NGS数据集(如ChIP-seq, RNA-seq, miRNA-seq, DNA-seq)的跟踪层。

作者:欧建宏,王永旭,朱丽华

维护者:欧建宏<建宏。你在umassmed。edu>

引文(从R内,输入引用(“trackViewer”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“trackViewer”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“trackViewer”)

超文本标记语言 trackViewer装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件可视化
版本 1.6.1
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.1.0),方法,GenomicRanges、网格
进口 GenomicAlignmentsGenomicFeaturesGvizpbapplyRsamtoolsrtracklayer尺度、工具、IRanges
链接
建议 biomaRtTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneRUnitBiocGenericsBiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 彗星
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 trackViewer_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 trackViewer_1.6.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) trackViewer_1.6.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) trackViewer_1.6.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/trackViewer/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/trackViewer/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南。将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心