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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅snpStats。

SnpMatrix XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:3.2

类和统计方法对大型SNP研究协会。这扩展了早些时候snpMatrix包,允许基因型的不确定性。

作者:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >

维修工:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >

安装

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文档

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browseVignettes (“snpStats”)

PDF		数据输入
PDF		置
PDF		归责和荟萃分析
PDF		LD统计
PDF		主成分分析
PDF		snpMatrix-differences
PDF		snpStats介绍
PDF		TDT)测试
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0),生存,矩阵、方法
进口	图形、grDevices统计,跑龙套,BiocGenerics,zlibbioc
链接
建议	hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GGBase,GGdata,ggtut
进口我	FunciSNP,GGtools,gQTLstats,gwascat,ldblock,餐
建议我	crlmm,GWASTools,VariantAnnotation
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	snpStats_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	snpStats_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	snpStats_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	snpStats_1.20.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/snpstats/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/
包下载报告	下载数据