要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“similaRpeak”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

similaRpeak

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见similaRpeak

similaRpeak:用于估计两个ChIP-Seq配置文件之间相似性级别的度量

Bioconductor版本:3.2

这个包计算分配ChIP-Seq配置文件之间相似程度的指标。

作者:Astrid Deschenes [cre, aut], Elsa Bernatchez [aut], Charles Joly Beauparlant [aut], Fabien Claude Lamaze [aut], Rawane Samb [aut], Pascal Belleau [aut], Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Louise Deschenes

引文(从R内,输入引用(“similaRpeak”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“similaRpeak”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“similaRpeak”)

超文本标记语言 similaRpeak:两条ChIP-Seq配置文件之间的相似度
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews BiologicalQuestionChIPSeqDifferentialExpression遗传学MultipleComparison软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 artist -2.0 |文件许可
取决于 R6(> = 2.0)
进口 rtracklayerGenomicAlignmentsRsamtools
链接
建议 RUnitBiocGenericsknitr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/adeschen/similaRpeak
BugReports https://github.com/adeschen/similaRpeak/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 similaRpeak_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 similaRpeak_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) similaRpeak_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) similaRpeak_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/similaRpeak/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/similaRpeak/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心