要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“similaRpeak”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见similaRpeak.
Bioconductor版本:3.2
这个包计算分配ChIP-Seq配置文件之间相似程度的指标。
作者:Astrid Deschenes [cre, aut], Elsa Bernatchez [aut], Charles Joly Beauparlant [aut], Fabien Claude Lamaze [aut], Rawane Samb [aut], Pascal Belleau [aut], Arnaud Droit [aut]
维护者:Astrid Louise Deschenes
引文(从R内,输入引用(“similaRpeak”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“similaRpeak”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“similaRpeak”)
超文本标记语言 | similaRpeak:两条ChIP-Seq配置文件之间的相似度 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | BiologicalQuestion,ChIPSeq,DifferentialExpression,遗传学,MultipleComparison,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | artist -2.0 |文件许可 |
取决于 | R6(> = 2.0) |
进口 | rtracklayer,GenomicAlignments,Rsamtools |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/adeschen/similaRpeak |
BugReports | https://github.com/adeschen/similaRpeak/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | similaRpeak_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | similaRpeak_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | similaRpeak_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | similaRpeak_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/similaRpeak/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/similaRpeak/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |