要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqPattern”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

seqPattern

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见seqPattern

在一组排序序列中可视化寡核苷酸模式和基序出现

Bioconductor版本:3.2

可视化寡核苷酸模式和序列基序出现在一个公共参考点中心的大序列集,并根据用户定义的特征进行排序。

作者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>

维护者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“seqPattern”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqPattern”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“seqPattern”)

PDF seqPattern
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews SequenceMatching软件可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.15.0)
进口 BiostringsGenomicRangesIRangesKernSmoothplotrix
链接
建议 BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7篮球选手RUnitBiocGenericsBiocStyle
SystemRequirements
增强了 平行
URL
全靠我
进口我 genomation
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 seqPattern_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 seqPattern_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) seqPattern_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) seqPattern_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/seqPattern/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/seqPattern/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心