安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“咆哮”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅咆哮。
Bioconductor版本:3.2
确定优先使用APA网站,比较两个生物条件,从已知的替代标准RNA-seq试验得到网站和比对。
作者:埃琳娜格拉希
维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >
从内部引用(R,回车引用(“咆哮”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“咆哮”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“咆哮”)
从RNA-seq比对确定微分APA使用 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件,转录 |
版本 | 1.6.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.0.1) |
进口 | GenomicRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments(> = 0.99.4)、方法rtracklayer,S4Vectors |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/vodkatad/roar/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | roar_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | roar_1.6.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | roar_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | roar_1.6.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/roar/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/roar/ |
包下载报告 | 下载数据 |