要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ rgsepd”）
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RGSEPD
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此软件包适用于生物导体的3.2版；对于稳定的最新版本，请参阅RGSEPD。
基因集富集 /投影显示
生物导体版本：3.2
R/GSEPD是用于R的生物信息学软件包，可通过自动化差异表达式（使用DESEQ2），然后是基因集富集（带有Goseq），最终是N二维，来帮助消除歧义的转录组样品（REDEQ IDS的RNA-seq计数矩阵）（refSeq ID的RNA-Seq计数）。投影以量化每个样品都像任何一种治疗组一样。
作者：卡尔·斯塔姆（Karl Stamm）
维护者：karl stamm
引用（从r内，输入引用（“ rgsepd”））：
安装
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文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rgsepd”）
| RGSEPD软件包简介 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因烯，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.0.0），deseq2，，，，Goseq（> = 1.17） |
| 进口 | GPLOTS，，，，Biomart，，，，org.hs.eg.db，，，，go.db，，，，基因组机，，，，哈希，，，，AnnotationDbi |
| 链接 | |
| 建议 | 引导， 工具，运行，，，，生物基因，，，，尼特，，，，Xtable |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | rgsepd_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rgSEPD_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | RGSEPD_1.2.0.TGZ |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | RGSEPD_1.2.0.TGZ |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/rgsepd/tree/release-3.2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rgsepd/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
