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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见regionReport．

生成用于探索一组区域的HTML报告

Bioconductor版本:3.2

生成HTML报告以探索一组区域，例如derfinder执行的碱基对分辨率下RNA-seq数据的不确定注释表达式分析的结果。

作者:Leonardo Collado-Torres [aut, cre]， Andrew E. Jaffe [aut]， Jeffrey T. Leek [aut, ths]

维护者:Leonardo Collado-Torres

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“regionReport”)

文档

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browseVignettes(“regionReport”)

超文本标记语言		使用来自bumphunter的数据的示例
超文本标记语言		regionReport简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DifferentialExpression，RNASeq，测序，软件，转录，可视化
版本	1.4.1
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.2)
进口	bumphunter(> = 1.7.6),derfinder(> = 1.1.0版),derfinderPlot(> = 1.3.2),devtools(> = 1.6),GenomeInfoDb，GenomicRanges，ggbio(> = 1.13.13),ggplot2、网格gridExtra，IRanges，knitcitations(> = 1.0.1),knitr(> = 1.6),knitrBootstrap(> = 0.9.0),mgcv，RColorBrewer，rmarkdown(> = 0.3.3),晶须
链接
建议	BiocStyle，biovizBase，开罗，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/leekgroup/regionReport
BugReports	https://github.com/leekgroup/regionReport/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	regionReport_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	regionReport_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	regionReport_1.4.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	regionReport_1.4.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/regionReport/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/regionReport/
软件包下载报告	下载数据