安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rSFFreader”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rSFFreader。
Bioconductor版本:3.2
rSFFreader读取序列,品质和夹点值设定触发器文件由罗氏454和生命科学离子激流测序fastq文件也存在类似的类。
作者:马特落定< mattsettles gmail.com >,山姆猎人,布莱斯•萨维尔,髂骨Zhbannikov, Kyu-Chul曹
维修工:马特落定< mattsettles gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“rSFFreader”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rSFFreader”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“rSFFreader”)
介绍rSFFreader | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,测序,软件 |
版本 | 0.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | ShortRead(> = 1.23.17) |
进口 | 方法,Biostrings,IRanges |
链接 | S4Vectors,IRanges,XVector,Biostrings |
建议 | xtable |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | hiReadsProcessor |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | rSFFreader_0.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | rSFFreader_0.18.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | rSFFreader_0.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/rsffreader/tree/release - 3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rSFFreader/ |
包下载报告 | 下载数据 |